江苏省中医药博物馆馆舍建筑面积11000m2，分为中国医史馆、江苏中医馆、中药馆、养生文化馆四个常设展厅和一个临时展厅，展陈面积4500m2，馆藏中医药历史藏品3900余件，中药标本71000余份。博物馆通过各类中医药器具、医籍文献和中药材标本的展示，呈现中国中医药悠久历史，彰显江苏中医药特色成就，揭示南京中医药大学文化底蕴，努力构建具有区域特色的研究、收集、保护、阐释和展示中医药文化遗产的殿堂。我馆现为全国中医药文化宣传教育基地、京津冀长三角珠三角博物馆联盟会员单位、江苏省博物馆学会理事单位、江苏省和南京市科普教育基地、南京现代科普场馆联盟成员单位、南京“世界文学之都”网络地标，栖霞区史志馆联盟成员单位、金陵小学中医药文化教育基地、南京市栖霞区科技志愿服务优秀集体等。

2023年，该馆立足藏品特色与数字资源，与文旅部门、中小学校等单位共建，举办形式多样的展览和科普教育活动。举办“博览本草，赓续医脉——药用植物腊叶标本展”，打造“博物致知”中医药文化传播品牌，举办中医药文化进校园等丰富多彩的活动。